Местом экспозиции, посвященной русскому церковному Расколу, стал храм Иоанна Златоуста. Это единственный старообрядческих храм в Ярославле, в котором проводятся богослужения по старообрядческому образцу и собирается община старообрядцев.
Экспозиция была собрана из личных вещей , веками хранившихся в семьях старообрядцев. Это рукописи, богослужебные предметы, предметы одежды. Храм гарантирует их сохранность.
Открытие музея приурочено к юбилею протопопа Аввакума, наиболее яркого автора средневековой русской литературы, написавшего автобиографическую книгу «Житие протопопа Аввакума», в которой описал Раскол, его последствия и гонения на представителей раскола. Описывая события собственной жизни, протопоп Аввакум запечатлел эпоху, в которой жил и которой принадлежал. Книга Аввакума до сих пор считается одним из выдающихся произведений русской литературы и «энциклопедией русской жизни» 17 века.